1.综合科。负责机关文电、会务、机要、文书档案、信息、政务公开、综治、保密、机构编制、人事、纪检、固定资产管理、财务以及其他行政事务、后勤保障工作;承担办公室机关综合协调、政务运转、督促检查工作。

        2.机关科。承担州委及其各部门、州人大及其常务委员会、州人民政府及其各部门、州政协和州级各民主党派、工商联、各人民团体机关、法院、检察院机构改革工作，并办理有关机构编制事项；协调州人民政府各部门之间以及各部门与县（市）之间的职责分工；承担全州行政编制总量管理、政法专项编制管理工作承担，拟订全州性行政编制分配方案；指导县（市）行政管理体制、机构改革和机构编制管理工作。

3.事业科。拟订全州事业单位管理体制和机构改革的总体方案，拟订各类事业单位机构编制标准；办理州属事业单位、使用事业编制的其他机构的机构编制事项；承担创新公共服务提供方式的研究工作；指导县（市）事业单位管理体制、机构改革和机构编制管理工作。

4.监督检查科。承担行政管理体制和机构改革方案、事业单位管理体制和机构改革方案、事业单位登记管理以及机构编制执行情况的监督检查和评估工作；承担“12310”举报电话受理工作，查处机构编制违法违纪行为；承担机构编制数据库和信息化建设工作；承担机构编制统计、审核和实名制管理工作；承担各类机构“政务”·“公益”中文域名注册审核上报工作。

5.登记管理科。承担管辖范围内和授权登记的事业单位设立、变更、注销、年度检验、公告发布、登记档案管理等工作；承担事业单位网上登记管理工作；承担登记管理方面行政复议、行政应诉的具体工作；指导县（市）事业单位登记管理工作。

6.法规体改科。研究起草机构编制制度规定和综合性文件；组织协调机构编制前瞻性理论研究；承担有关规范性文件的合法性审查和法律法规征求意见的回复工作；综合协调行政管理体制改革、事业单位改革，以及相关领域体制改革工作。